Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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