Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms