Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms