Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN11Q06124 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN11Q06124 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms