Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNB3Q05901 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms