Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms