Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDPQ00604 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms