Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
JAG1P78504 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
JAG1P78504 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms