Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
HBBP68871 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms