Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP46P62068 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP46P62068 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms