Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARL4CP56559 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARL4CP56559 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARL4CP56559 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms