Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAD23AP54725 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms