Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA8P48165 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.6 ms