Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBX2P40425 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PBX2P40425 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms