Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGP37231 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms