Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms