Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASQ1P31415 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CASQ1P31415 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms