Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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