Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PRKCHP24723 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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