Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HRCP23327 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HRCP23327 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRCP23327 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRCP23327 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms