Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP2B1P20020 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms