Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFE3P19532 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms