Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEFHP12036 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEFHP12036 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEFHP12036 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms