Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SFTPCP11686 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SFTPCP11686 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SFTPCP11686 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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