Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DMDP11532 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DMDP11532 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DMDP11532 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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