Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms