Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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