Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF254O75437 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms