Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TLR5O60602 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TLR5O60602 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms