Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB3O43889 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms