Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8W031 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8W031 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8W031 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
F8W031 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8W031 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms