Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms