Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RIMS3Q9UJD0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIMS3Q9UJD0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms