Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST12Q9NRB3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms