Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-5Q9HDB9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms