Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF6Q9BYE7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms