Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IFT27Q9BW83 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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