Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRACR2AQ9BSW2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms