Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
UBE2E2Q96LR5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms