Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIC2Q96JB3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms