Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms