Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms