Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms