Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms