Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD1Q8NHV4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms