Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF397Q8NF99 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms