Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM71DQ8N9W8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM71DQ8N9W8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM71DQ8N9W8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM71DQ8N9W8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM71DQ8N9W8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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