Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ZIC4Q8N9L1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZIC4Q8N9L1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms