Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS3Q8IXF0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms