Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRIM48Q8IWZ4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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